Installeer Windows ME in alle gevallen op een lege vaste schijf. Dit is beter dan een bestaande versie van Windows bij te werken naar Windows ME, aangezien de kans op problemen bij een 'schone' installatie verkleind wordt. Daarmee kunt u er zeker van zijn dat alle verouderde bestanden verwijderd zijn. Tijdens de installatieprocedure van de Upgrade-versie van Windows Me op een lege vaste schijf dient u wel de CD-rom van de vorige Windows-versie bij de hand te houden. Hierom wordt namelijk gevraagd door Setup.